随后，最高军事当局根本不顾敌强我弱的总体形势，一意孤行强行调集全国各处大军在徐州附近开始集结，企图与日军决战，因而使会战在后期陷于被动。尽管如此，这次会战也大大的消耗了日军有生力量，迟滞了日军进攻速度，为随后的武汉保卫战赢得了时间。
整个徐州会战，日军前后共动用8个师、5个旅约30万人。萧家军以及、**部队前后有70个师约100万人，从四月初到九月份前后历时5个月。这次会战钳制和消耗了日军有生力量，除了给了日军以巨大打击外，还迟滞了日军进攻速度，此战最重要的影响在于使中国人民相信自己有击败日本的能力。
1938年9月，根据萧飞的决定，玄武师驻守的临沂开始在在沂（水）蒙（阴）地区成立根据地并成立了萧家军驻防山东守备司令部，统一指挥山东的萧家军各部队。在萧家军的带领下各地的武装开始在冀鲁边、鲁西、胶东、鲁东、鲁中、鲁东南、湖西、苏皖边等地广泛开展游击战争，开辟了新的地区，扩大了根据地。年底玄武师下辖有8个加强团5余人，3个预备团2余人、5个辎重大队2余人。总计9余人。
在短短半年多的时间里，从菏泽一带到鲁西平原、从冀鲁边区到苏鲁豫皖边区，再到临沂、日照一带，大片的山东南部土地落入萧飞的控制之中。萧飞为加强对军队的绝对领导，将萧家军各部分配来的一批有作战经验的干部分配到各支队担任领导工作，对部队进行了初步整顿，调整和配备了各级领导骨干，加强了萧飞对部队的绝对领导，从而加速了山东抗日武装的正规化建设。这些由萧飞领导的抗日武装，土生土长，由小到大，由弱变强，到1938年底已发展到二十万之众，为萧飞进一步收复山东提供了必要的武装力量。
此后经过半年多的发展，萧飞通过美国驻河南的领事关系大批购买了包括重型榴弹炮、山炮在内的重各种口径的10余条火炮生产线！加上购买的火炮数量，现在萧家军的整体实力扩大了2倍之多。
经过统计青龙师已有近12部队，玄武师有9万的部队，朱雀师、白虎师2个师团也有18之众！1938年11月29日萧家军在临沂河南洛阳召开了军事整改大会，萧飞重新调整了兵力部署。
“各位军官、各位弟兄们！我很高兴能在这里再一次看见你们！跟你们欢聚一堂！”萧飞开始了演讲。
“啪啪啪！”“啪啪啪！”底下坐着的士兵、军官们纷纷鼓起掌来。“弟兄们！经过半年多的发展，咱们萧家军从最初的民团几万人发展到了现在的几十万部队！这里面都是你们的功劳！虽然我们萧家军在临沂、台儿庄一带损失惨重！但是我们打胜了！你们都是好样的！”萧飞顿了顿。底下再次响起来热烈的掌声。
“弟兄们！由于我们的部队增速过快，已经大大超过了我们预期的目标！表面上我们虽然隶属于**，但是我们决不是他们一些人手里的旗子！所以从现在起，我宣布河南、山东2省虽然归属国民政府，但是我们的各项措施都将会有我们自己决定！根据军部的计划、部署！现在起，我宣布：我们萧家军底下的4个师全部改为军一级番号！具体的由候再参谋长宣布！”萧飞喝了一口水坐了下去。
“什么？我们自己决定？“将军那不是我们自己独自自治了？”“是啊！将军！”底下的人一听自己要独自了，个个议论纷纷。
“弟兄们！听我说！我们不是自治，我们在山东、河南的各项指令我们说了算！谁也别想管到我们！但是我们表面还是属于国民政府管理！但是在这2个地方我们说了算！谁要是欺负我们咱们就狠狠的揍他！”萧飞挥挥手示意大家安静补充说道。
“哈哈！这样啊！太好了！那以后我们就不用鸟那些国民政府了！”“就是！以后我们还不是想怎么干就怎么干！”士兵们一听是这么回事，兴奋的讨论起来。
“行了！继续听参谋长的！”萧飞喝了口水喊道，立即场面安静了下来。看见场面安静了候再起身开口道：“各位军官、各位弟兄们！下边我宣布萧家军军部第121号整改命令！
青龙师改为青龙军、白虎师改为白虎军、玄武师改为玄武军、朱雀师改为朱雀军！从现在起，每一军里面满编人数为10人！为了方便大家理解具体的计划如下：青龙军军长张大胆，军衔为中将。玄武军军长韩春，军衔中将。白虎军军长李林，军衔中将。朱雀军军长吴升，军衔中将！川军军长王铭章，军衔中将！每一个军级单位下辖5个作战师：1师、2师、三师、4师、五师。每个师2人，下辖4个加强团1团、2团、3团、4团，每一个团5000余人下辖5个营，团级火力为重机枪50挺、轻机枪100挺、98式毛瑟5000支、大刀2000把、手榴弹500箱、90mm轻迫击炮200门、150mm中迫击炮100门。另外每一个师额外下辖2个重型炮团1余人：1炮、二炮。
每个炮团有装备最新的美式火炮M7“牧师”自行榴弹炮50门、M40“远程汤姆”155毫米自行火炮40辆、M2型105mm榴弹炮50门、M59型155mm榴弹炮50门、75mm山炮100门、105mm山炮150门。下辖4个炮营。
青龙军抽调一师其余以后驻防连云港、日照、临沂、藤县一带；玄武军抽调一师其余以后驻守山东菏泽、商丘、枣庄一带；白虎军抽调一师其余驻守菏泽、安阳、洛阳一带；川军全体官兵驻守夏邑县、商丘一带密切注意徐州的鬼子动向；朱雀军1个师跟各军抽调的部队组成预备队在淮阳县驻军随时支援前线，其余各部配合省内的警察、民兵分别驻守各个城市！”候再说完以后敬了个军礼坐了回去。
“太好了！这下我们一个营就有1000余人啊！”“太棒了！！我们的重炮团有大小500多门以后再也不用怕鬼子了！”“就是啊！”“哈哈！以后鬼子碰见我们还不是就只有跑的份了啊！”底下的士兵们兴高采烈的、眉飞色舞的高声讨论着。
看见士兵们这么兴奋，萧飞也是由衷的开心。是啊！多久了，萧家军跟鬼子打仗一直就是被鬼子的炮火压着打，要不是鬼子仗着自己的炮火猛烈自己的部队也不会每次作战后都是伤亡惨重。现在自己手里有4个整编军外加川军的一个军、算上辎重大队总共正规军的实力就在近50左右！虽然自己的兵力发展很是迅速但是基本上也已经饱和了！自己目前的实力只能供应的起这些正规军的日常开销！再加上河南、山东各地的民兵差不多手里就有近80万的部队！这可真是手握重兵了！虽然目前跟日军相比差距还是很大，但是萧飞毕竟有了阻挡日军大范围进攻的实力！
“弟兄们！再告诉你们个好消息！从今天开始每个士兵的军衔提高一级，班长当排长、排长当连长、连长当营长、营长当团长、团长当师长！士兵们的军饷每人每月多拿4块大洋！”萧飞乘机说道。
“太好了！“”将军万岁！“”将军万岁！“萧家军万岁！”士兵们这次彻底的沸腾了！
以此同时的国民政府也于1938年12月召开了大会，委员长重新划分了全国战区。调整了兵力部署：特意嘱咐第一战区司令长官：卫立煌。带领着第2、第3集团军，共12个步兵师，一个步兵旅，一个骑兵师，一个骑兵旅。重点监视河南、山东南部一带的萧家军。
此时的**兵力总计：250个步兵师，29个独立步兵旅；13个骑兵师，10个独立骑兵旅。仅步兵师来看，经过一年多的抗战，不但没被日军消灭，反比1938年1月的210个步兵师，多出40个师。**各个军队在对日作战中，也得到提高和加强。
此时徐州会战早已经结束了！中日双方都在静静的*着各自的伤口，准备瞅准机会随时给对手一击！
经过几天的部署，萧飞在交代完所有的军务以后立刻回到了家中。此时萧飞的儿子都已经出生2个多月了！萧飞心里可是一个劲的惦记着。
很快，萧飞就带着些随从急急赶回了淮阳县城。
“烟儿！烟儿！”萧飞一到家门口就急不可耐的跳下了车朝屋子里跑去。“将军好！”门口的哨兵看见萧飞回来顿时一个个的跟打了鸡血似的，个个站的笔直！萧飞对着众人一笑便继续往院子奔去。
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